《蓝巨星和绿豆鲨之国学课堂》的故事发生在珊瑚村和沉船谷之间。捕鱼公司老板绿豆鲨，带领招财和进宝依然驻扎在沉船谷，他们继续想方设法侵扰珊瑚村，抓捕里面的鱼儿。面对绿豆鲨一波波的进攻，主角蓝巨星肩负起更为艰巨的使命，在这一季中他的聪明和勇敢得到了更大的提升，他和小伙伴们团结一心，挫败敌人一次次的进攻，保护美丽的家园。

　　该片大胆采用国际先进三维动画技术来制作动画片，采用了与国际同步的3D立体高清技术制作，抢占国内3D电视市场，在2012年，观众就可以戴着3D立体眼镜在家观看3D版的《蓝巨星和绿豆鲨之国学课堂》。

　　在全新的故事中，海洋元素和中国传统文化得到加强，使之得以完美结合，在有趣生动的故事中传达科学知识、生活常识，并传承民族文化。美术风格上突出海洋特色，场景以海底的珊瑚、海藻、礁石为主，建筑和道具的设计上，融入海洋元素和中国传统文化元素。色彩丰富、鲜艳，造型细腻、精致，符合小观众的审美喜好。